Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms