Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms