Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms