Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms