Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN11Q06124 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN11Q06124 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN11Q06124 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN11Q06124 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN11Q06124 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN11Q06124 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN11Q06124 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN11Q06124 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN11Q06124 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN11Q06124 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN11Q06124 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN11Q06124 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPN11Q06124 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN11Q06124 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN11Q06124 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN11Q06124 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN11Q06124 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN11Q06124 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN11Q06124 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN11Q06124 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN11Q06124 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN11Q06124 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPN11Q06124 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN11Q06124 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN11Q06124 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN11Q06124 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN11Q06124 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN11Q06124 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN11Q06124 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN11Q06124 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN11Q06124 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN11Q06124 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN11Q06124 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN11Q06124 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms