Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSPL2Q05D32 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms