Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC18A2Q05940 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms