Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms