Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ID3Q02535 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ID3Q02535 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ID3Q02535 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ID3Q02535 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ID3Q02535 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ID3Q02535 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ID3Q02535 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ID3Q02535 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ID3Q02535 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ID3Q02535 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ID3Q02535 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ID3Q02535 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms