Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms