Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms