Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms