Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMF1P82094 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMF1P82094 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TMF1P82094 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMF1P82094 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMF1P82094 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMF1P82094 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMF1P82094 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMF1P82094 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMF1P82094 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMF1P82094 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMF1P82094 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMF1P82094 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMF1P82094 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMF1P82094 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMF1P82094 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMF1P82094 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMF1P82094 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMF1P82094 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMF1P82094 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMF1P82094 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMF1P82094 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMF1P82094 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMF1P82094 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TMF1P82094 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMF1P82094 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMF1P82094 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMF1P82094 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TMF1P82094 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMF1P82094 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMF1P82094 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMF1P82094 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMF1P82094 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMF1P82094 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMF1P82094 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMF1P82094 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMF1P82094 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMF1P82094 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMF1P82094 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMF1P82094 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMF1P82094 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMF1P82094 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMF1P82094 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMF1P82094 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMF1P82094 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMF1P82094 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TMF1P82094 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMF1P82094 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMF1P82094 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMF1P82094 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMF1P82094 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMF1P82094 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMF1P82094 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMF1P82094 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMF1P82094 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMF1P82094 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMF1P82094 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMF1P82094 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMF1P82094 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMF1P82094 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMF1P82094 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMF1P82094 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMF1P82094 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMF1P82094 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMF1P82094 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMF1P82094 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMF1P82094 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMF1P82094 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMF1P82094 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMF1P82094 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMF1P82094 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMF1P82094 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMF1P82094 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMF1P82094 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TMF1P82094 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms