Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX6P78412 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX6P78412 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX6P78412 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX6P78412 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX6P78412 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX6P78412 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX6P78412 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX6P78412 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX6P78412 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX6P78412 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX6P78412 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX6P78412 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX6P78412 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX6P78412 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX6P78412 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX6P78412 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX6P78412 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX6P78412 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX6P78412 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX6P78412 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX6P78412 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX6P78412 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX6P78412 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX6P78412 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX6P78412 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX6P78412 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX6P78412 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX6P78412 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX6P78412 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX6P78412 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX6P78412 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX6P78412 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX6P78412 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX6P78412 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX6P78412 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX6P78412 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX6P78412 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX6P78412 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX6P78412 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX6P78412 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX6P78412 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX6P78412 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms