Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms