Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GNB1P62873 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GNB1P62873 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GNB1P62873 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GNB1P62873 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GNB1P62873 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GNB1P62873 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GNB1P62873 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GNB1P62873 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms