Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCS1P62166 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCS1P62166 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms