Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms