Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL3P58872 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms