Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA9P57773 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA9P57773 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA9P57773 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJA9P57773 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
GJA9P57773 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJA9P57773 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJA9P57773 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA9P57773 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA9P57773 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA9P57773 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA9P57773 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA9P57773 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA9P57773 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA9P57773 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA9P57773 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA9P57773 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA9P57773 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA9P57773 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA9P57773 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA9P57773 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA9P57773 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms