Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms