Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RWDD2BP57060 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RWDD2BP57060 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms