Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP5P51878 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP5P51878 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP5P51878 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP5P51878 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP5P51878 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP5P51878 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP5P51878 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP5P51878 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP5P51878 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP5P51878 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP5P51878 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP5P51878 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP5P51878 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP5P51878 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP5P51878 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP5P51878 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP5P51878 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP5P51878 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP5P51878 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP5P51878 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP5P51878 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP5P51878 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP5P51878 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP5P51878 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP5P51878 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP5P51878 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP5P51878 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP5P51878 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP5P51878 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP5P51878 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP5P51878 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP5P51878 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP5P51878 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP5P51878 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP5P51878 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP5P51878 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP5P51878 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP5P51878 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP5P51878 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP5P51878 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP5P51878 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP5P51878 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms