Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETV1P50549 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETV1P50549 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETV1P50549 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETV1P50549 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETV1P50549 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETV1P50549 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ETV1P50549 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETV1P50549 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETV1P50549 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETV1P50549 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETV1P50549 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETV1P50549 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETV1P50549 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETV1P50549 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETV1P50549 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETV1P50549 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETV1P50549 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETV1P50549 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETV1P50549 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms