Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP3P50461 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP3P50461 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP3P50461 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP3P50461 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP3P50461 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP3P50461 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP3P50461 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP3P50461 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CSRP3P50461 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSRP3P50461 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSRP3P50461 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSRP3P50461 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSRP3P50461 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSRP3P50461 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms