Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms