Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC34P49427 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC34P49427 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC34P49427 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC34P49427 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC34P49427 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC34P49427 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC34P49427 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC34P49427 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC34P49427 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC34P49427 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC34P49427 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms