Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC11A1P49279 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms