Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms