Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms