Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCAMP43121 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCAMP43121 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCAMP43121 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCAMP43121 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCAMP43121 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCAMP43121 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCAMP43121 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCAMP43121 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCAMP43121 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCAMP43121 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCAMP43121 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCAMP43121 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCAMP43121 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCAMP43121 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCAMP43121 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCAMP43121 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCAMP43121 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCAMP43121 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCAMP43121 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCAMP43121 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCAMP43121 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MCAMP43121 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MCAMP43121 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCAMP43121 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCAMP43121 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCAMP43121 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCAMP43121 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCAMP43121 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCAMP43121 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCAMP43121 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCAMP43121 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCAMP43121 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCAMP43121 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCAMP43121 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCAMP43121 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCAMP43121 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCAMP43121 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCAMP43121 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCAMP43121 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCAMP43121 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCAMP43121 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCAMP43121 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCAMP43121 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCAMP43121 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCAMP43121 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCAMP43121 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCAMP43121 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCAMP43121 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCAMP43121 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCAMP43121 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCAMP43121 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCAMP43121 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCAMP43121 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCAMP43121 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCAMP43121 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCAMP43121 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCAMP43121 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCAMP43121 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCAMP43121 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCAMP43121 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCAMP43121 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MCAMP43121 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCAMP43121 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCAMP43121 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCAMP43121 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCAMP43121 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MCAMP43121 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCAMP43121 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MCAMP43121 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCAMP43121 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCAMP43121 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCAMP43121 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCAMP43121 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCAMP43121 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCAMP43121 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCAMP43121 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MCAMP43121 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCAMP43121 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms