Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM6P40199 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM6P40199 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms