Protein–RNA interactions for Protein: P31937

HIBADH, 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIBADHP31937 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIBADHP31937 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms