Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB2P29033 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB2P29033 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB2P29033 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB2P29033 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB2P29033 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB2P29033 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB2P29033 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB2P29033 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB2P29033 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB2P29033 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB2P29033 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB2P29033 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB2P29033 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB2P29033 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB2P29033 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB2P29033 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB2P29033 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB2P29033 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB2P29033 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB2P29033 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB2P29033 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB2P29033 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB2P29033 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms