Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB4P28070 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB4P28070 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB4P28070 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB4P28070 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB4P28070 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB4P28070 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB4P28070 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB4P28070 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB4P28070 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB4P28070 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB4P28070 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB4P28070 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB4P28070 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB4P28070 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms