Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMLP26374 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMLP26374 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMLP26374 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMLP26374 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMLP26374 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMLP26374 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMLP26374 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMLP26374 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMLP26374 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMLP26374 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMLP26374 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMLP26374 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMLP26374 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMLP26374 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMLP26374 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMLP26374 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMLP26374 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMLP26374 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMLP26374 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMLP26374 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMLP26374 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMLP26374 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMLP26374 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMLP26374 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMLP26374 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMLP26374 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMLP26374 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMLP26374 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMLP26374 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMLP26374 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMLP26374 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMLP26374 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMLP26374 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMLP26374 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMLP26374 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMLP26374 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMLP26374 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMLP26374 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMLP26374 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMLP26374 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMLP26374 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMLP26374 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMLP26374 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMLP26374 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMLP26374 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMLP26374 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMLP26374 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMLP26374 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMLP26374 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMLP26374 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMLP26374 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMLP26374 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMLP26374 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMLP26374 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMLP26374 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMLP26374 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMLP26374 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMLP26374 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMLP26374 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMLP26374 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMLP26374 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMLP26374 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMLP26374 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMLP26374 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMLP26374 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMLP26374 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMLP26374 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMLP26374 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMLP26374 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMLP26374 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMLP26374 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMLP26374 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMLP26374 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMLP26374 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMLP26374 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMLP26374 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMLP26374 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMLP26374 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMLP26374 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMLP26374 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMLP26374 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMLP26374 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMLP26374 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMLP26374 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMLP26374 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMLP26374 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms