Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms