Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GCSHP23434 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GCSHP23434 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSHP23434 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCSHP23434 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCSHP23434 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCSHP23434 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCSHP23434 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCSHP23434 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCSHP23434 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCSHP23434 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCSHP23434 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCSHP23434 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCSHP23434 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCSHP23434 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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GCSHP23434 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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GCSHP23434 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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GCSHP23434 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSHP23434 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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