Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HRCP23327 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HRCP23327 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HRCP23327 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HRCP23327 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HRCP23327 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HRCP23327 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HRCP23327 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
HRCP23327 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HRCP23327 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HRCP23327 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HRCP23327 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HRCP23327 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HRCP23327 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HRCP23327 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HRCP23327 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HRCP23327 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HRCP23327 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HRCP23327 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HRCP23327 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HRCP23327 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HRCP23327 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HRCP23327 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HRCP23327 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HRCP23327 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HRCP23327 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HRCP23327 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HRCP23327 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HRCP23327 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
HRCP23327 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HRCP23327 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HRCP23327 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HRCP23327 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HRCP23327 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HRCP23327 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HRCP23327 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HRCP23327 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HRCP23327 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HRCP23327 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HRCP23327 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HRCP23327 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HRCP23327 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HRCP23327 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HRCP23327 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HRCP23327 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HRCP23327 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HRCP23327 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HRCP23327 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HRCP23327 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HRCP23327 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HRCP23327 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HRCP23327 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HRCP23327 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HRCP23327 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HRCP23327 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HRCP23327 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HRCP23327 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HRCP23327 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HRCP23327 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HRCP23327 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HRCP23327 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HRCP23327 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HRCP23327 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HRCP23327 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HRCP23327 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HRCP23327 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HRCP23327 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HRCP23327 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HRCP23327 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HRCP23327 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HRCP23327 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HRCP23327 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
HRCP23327 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HRCP23327 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HRCP23327 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HRCP23327 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HRCP23327 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms