Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERBB3P21860 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms