Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF3P18847 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF3P18847 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF3P18847 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF3P18847 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF3P18847 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF3P18847 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF3P18847 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF3P18847 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF3P18847 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF3P18847 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF3P18847 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF3P18847 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF3P18847 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF3P18847 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF3P18847 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF3P18847 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF3P18847 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF3P18847 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF3P18847 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF3P18847 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF3P18847 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF3P18847 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF3P18847 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF3P18847 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF3P18847 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF3P18847 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF3P18847 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF3P18847 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF3P18847 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF3P18847 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF3P18847 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF3P18847 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATF3P18847 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATF3P18847 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATF3P18847 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATF3P18847 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF3P18847 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF3P18847 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF3P18847 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF3P18847 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF3P18847 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF3P18847 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF3P18847 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF3P18847 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF3P18847 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF3P18847 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF3P18847 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF3P18847 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF3P18847 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF3P18847 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF3P18847 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF3P18847 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF3P18847 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF3P18847 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF3P18847 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF3P18847 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF3P18847 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF3P18847 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF3P18847 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF3P18847 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF3P18847 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF3P18847 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF3P18847 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF3P18847 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF3P18847 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF3P18847 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF3P18847 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF3P18847 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF3P18847 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF3P18847 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF3P18847 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF3P18847 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF3P18847 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF3P18847 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms