Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PDE6GP18545 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PDE6GP18545 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PDE6GP18545 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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PDE6GP18545 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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PDE6GP18545 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PDE6GP18545 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PDE6GP18545 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PDE6GP18545 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PDE6GP18545 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PDE6GP18545 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PDE6GP18545 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PDE6GP18545 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PDE6GP18545 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PDE6GP18545 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PDE6GP18545 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PDE6GP18545 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PDE6GP18545 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PDE6GP18545 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PDE6GP18545 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PDE6GP18545 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PDE6GP18545 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PDE6GP18545 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PDE6GP18545 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PDE6GP18545 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PDE6GP18545 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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