Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DESP17661 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DESP17661 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DESP17661 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DESP17661 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DESP17661 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DESP17661 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DESP17661 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DESP17661 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DESP17661 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DESP17661 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DESP17661 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DESP17661 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DESP17661 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DESP17661 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DESP17661 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DESP17661 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DESP17661 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DESP17661 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DESP17661 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DESP17661 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DESP17661 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DESP17661 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
DESP17661 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms