Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms