Protein–RNA interactions for Protein: P16112

ACAN, Aggrecan core protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACANP16112 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACANP16112 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACANP16112 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACANP16112 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACANP16112 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACANP16112 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACANP16112 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACANP16112 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACANP16112 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACANP16112 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACANP16112 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACANP16112 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACANP16112 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACANP16112 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACANP16112 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACANP16112 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACANP16112 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms