Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD46P15529 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD46P15529 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD46P15529 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD46P15529 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD46P15529 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD46P15529 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD46P15529 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD46P15529 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD46P15529 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD46P15529 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD46P15529 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD46P15529 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD46P15529 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD46P15529 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD46P15529 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD46P15529 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CD46P15529 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CD46P15529 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CD46P15529 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD46P15529 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CD46P15529 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD46P15529 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD46P15529 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD46P15529 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms