Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRF1P14222 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRF1P14222 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms