Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYL1P12980 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYL1P12980 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYL1P12980 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms