Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms