Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPRP12270 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPRP12270 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPRP12270 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPRP12270 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPRP12270 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPRP12270 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPRP12270 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPRP12270 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TPRP12270 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPRP12270 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPRP12270 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPRP12270 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TPRP12270 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPRP12270 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPRP12270 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPRP12270 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TPRP12270 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPRP12270 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TPRP12270 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TPRP12270 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPRP12270 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPRP12270 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRP12270 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRP12270 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRP12270 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRP12270 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRP12270 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRP12270 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRP12270 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRP12270 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRP12270 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRP12270 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRP12270 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRP12270 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRP12270 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRP12270 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRP12270 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRP12270 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRP12270 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRP12270 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRP12270 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRP12270 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPRP12270 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPRP12270 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPRP12270 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPRP12270 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPRP12270 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPRP12270 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPRP12270 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPRP12270 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPRP12270 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPRP12270 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPRP12270 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPRP12270 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPRP12270 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPRP12270 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRP12270 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRP12270 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms